Leczenie atopowego zapalenia skóry możemy podzielić na: leczenie farmakologiczne miejscowe oraz lecznie ogólnoustrojowe. Niezwykle istotnym jest, by każdy rodzaj terapii konsultować z dermatologiem, gdyż niektóre leki mogą dawać niepożądane skutki uboczne. Większej ostrożności wymaga także leczenie małych dzieci, które stanowią znaczny odsetek pacjentów. Podstawną terapii jest zawsze codzienna pielęgnacja skóry oraz unikanie sytuacji, w której byłaby narażona na niekorzystne działanie czynników zewnętrznych. Miejscowo używa się maści z glikokortykosteroidami – o działaniu przeciwalergicznym, przeciwzapalnym oraz przeciwświądowym. Skutki uboczne są dość liczne, mogą wystąpić: rozstępy, zmiany skóry (zanikowe), efekty ogólnoustrojowe. Dlatego specyfiki te są podawane stopniowo – od najsłabszych preparatów przez krótki okres. Oprócz tego – nie zaleca się ich stosowania u dzieci. Jako, iż badania nad atopowym zapaleniem skóry wciąż są prowadzone – możliwe że w niedługim czasie pojawi się więcej rodzajów leków, nie tylko steroidowych.W zaostrzeniach objawów choroby, oraz przy skłonności do zakażeń chorej skóry, zaleca się stosowanie leków przeciwdrobnoustrojowych – antyseptyków. Leczenie ogólnoustrojowe atopowego zapalenia skóry polega na podawaniu glikokortykosteroidów doustnie. Jeżeli jednak choroba ma cięższy przebieg – pomóc może leczenie immunosupresyjne. Niestety – mimo iż łagodzi ciężkie zaostrzenie choroby, może mieć niekorzystny wpływ na nerki. Dodatkowo stosowanymi lekami są – antybiotyki (przy zakażeniach bakteryjnych) oraz leki przeciwhistaminowe. Aplikuje się je, bo działają sedatywnie, przeciwzapalnie i zmniejszają uczucie świądu. Coraz częściej pacjencji decydują się też na światłoterapię. Niezależnie od wybranej formy lecznia atopowego zapalenia skóry warto przede wszystkim zadbać o właściwą pielęgnacje, używanie produktów delikatnie myjących, unikanie alergenów, dymu tytoniowego, chlorowanej wody, brudu, pyłu, zwyczajnego mydła. Konieczne jest nawilżanie oraz natłuszczanie skóry a także wzmacnianie jej mechanizmów obronnych (zwłaszcza u dzieci).